一种基于结构特征的DNA绑定残基预测方法[CN202110081107.3] - 浙江工业大学

专利申请

2021-01-21
公布公告

2024-03-26
授权日期

2024-03-26
终止

2034-03-24

一种基于结构特征的DNA绑定残基预测方法

* 专利信息仅供参考，不具有法律效力。有效专利

注册号： CN202110081107.3 申请日期： 2021-01-21 专利主类别： G16B15/20 {{ classMap["G16B15/20"] }}

申请人名称：浙江工业大学

查看申请人名下所有专利

申请人地址：浙江省杭州市下城区朝晖六区潮王路18号

专利分类项目

专利注册信息

初审公告期号	2021-01-21	初审公告日期	2024-03-26
注册公告期号	2024-03-26	注册公告日期	2024-03-26
专用权期限	2024-03-26 - 2034-03-24	专利类型	发明授权
代理组织机构	杭州斯可睿专利事务所有限公司查看该机构代理的所有专利

专利介绍

一种基于结构特征的DNA绑定残基预测方法，首先，根据输入的待进行DNA绑定残基预测的蛋白质结构信息，以任一残基为球心，R为半径，通过以下四步获取该残基的特征向量：1)统计该球内20种常见类型残基出现的频率，记作#imgabs0#2)统计该球内三类二级结构类别的残基出现的频率，记作#imgabs1#3)统计该球内三类溶剂可及性类别的残基出现的频率，记作#imgabs2#4)将步骤1)至3)中的#imgabs3#串联成一个特征向量；然后，构建样本集并训练所搭建的一维卷积神经网络；最后，将蛋白质结构中残基的特征向量输入训练的模型中，根据模型输出概率是否大于阈值threshold，进而判断对应残基是否为DNA绑定残基。本发明计算代价小、预测精度高。

法律进度