• 专利申请
    2022-04-21
  • 公布公告
    2023-03-21
  • 授权日期
    2023-03-21
  • 终止
    2033-03-18
评估基因组组装完整度方法及装置
评估基因组组装完整度方法及装置
* 专利信息仅供参考，不具有法律效力。 有效专利
CN202210423265.7 2022-04-21 G16B30/20 {{ classMap["G16B30/20"] }}
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四川省内江市东兴区东桐路内江师范学院
专利分类项目

G16B30/20 :

G16B35/00 :

专利注册信息
初审公告期号 2022-04-21 初审公告日期 2023-03-21
注册公告期号 2023-03-21 注册公告日期 2023-03-21
专用权期限 2023-03-21 - 2033-03-18 专利类型 发明授权
代理组织机构 北京元本知识产权代理事务所 查看该机构代理的所有专利
专利介绍
本发明公开了一种评估基因组组装完整度方法及装置，根据测序报告确定测序reads的长度和测序错误率；在基因组序列中的随机位置上产生模拟reads；根据测序错误率在模拟产生的reads上进行错误性碱基替换；对实际和模拟产生的reads逐个碱基进行一定长度短片段kmer的抽取，并比较其反向互补配对序列，取在字母表排列在前的kmer作为序列标识；根据不同标识kmer的出现频次分布，计算所有kmer的频次深度分布；根据模拟测序数据产生的kmer频次深度分布与实际测序数据产生的kmer频次深度分布来评估基因组组装完整度。本发明整体设计不依赖于其他数据库，采用简单可行的手段对基因组进行科学合理的完整性评估。
法律进度

  • 2023-03-21 授权 ...

  • 2022-07-26 实质审查的生效 IPC(主分类): G16B 30/20 专利申请号: 202210423265.7 申请日: 2022.04 ...

  • 2022-07-08 公开 ...

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